如果购买二套房住房，仍然是可以使用公积金贷款的。对于职工提出的明确第二套房以及90平米以下的住房首付款比例政策的要求，《规定》里面的第十四条增加了“首付款比例不得低于国家规定的首付款比例要求”的规定，也确定了适用国家有关规定的原则。
按照城乡建设部，财政部，人行以及银监会一起印发的《关于规范住房公积金个人住房贷款政策有关问题的通知》规定，使用过公积金贷款购买第一套房的时候，套型建筑面积在90平米以下的，首付款比例最低是20%，如果建筑面积在90平米以上的话，贷款首付比例就不能低于30%。
如果在这之前，按揭购买过一套住房，然后又卖了，准备新购一套商品住房的，申请公积金贷款依然是可以按照第一套房来处理，并且享受首套房贷款优惠政策。公积金贷款跟商业银行不同之处在于，商业银行会认房认贷，而公积金只是认房不认贷。也就是说，公积金管理中心如果看到申请人名下有房产的话，就可以不计算他们拥有的房产还有以往的贷款记录，都是按照二套房处理。
