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上海市普陀区疾病预防控制中心成立于1999年12月，是在原区卫生防疫站、区结核病防治所、区性病防治中心、区肿瘤防治办公室等疾病预防控制机构的基础上整合而成。
中心位于丹巴路1628号，占地14.9亩，建筑面积1.25万平方米。
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